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Arrêt maladie : une avancée favorable pour les agents de la fonction publique

Économie > Gouvernement > Maladie > Carence
Par Morgan Fromentin,  publié le 29 janvier 2026 à 11h00.
Économie
Médecin

Image d'illustration. Médecin généraliste en consultationADN

Les agents de la fonction publique bénéficient d’une évolution favorable concernant leurs arrêts maladie. De récentes mesures ou décisions viennent améliorer leurs droits ou conditions, apportant un soulagement notable aux fonctionnaires concernés par des périodes d’incapacité temporaire.

Tl;dr

  • Suppression de l’allongement du délai de carence en 2026.
  • Projet initial visait à aligner public et privé.
  • Les arrêts maladie moins bien indemnisés depuis mars 2025.

L’abandon de l’allongement du délai de carence pour les fonctionnaires

Dans un contexte budgétaire tendu, les députés ont tranché ce mardi : la suppression de l’allongement du délai de carence en cas d’arrêt maladie pour les agents de la fonction publique a été actée au sein du budget 2026, selon les informations rapportées par MoneyVox. Cette mesure, initialement intégrée au projet de loi de finances, prévoyait d’étendre le délai non indemnisé de un à trois jours. L’objectif affiché ? Instaurer une certaine équité avec le secteur privé.

Des arguments contestés autour de l’alignement public-privé

Pourtant, cet argument d’« alignement » n’a pas convaincu tout le monde. Un amendement, porté par plusieurs élus, dénonçait un prétexte jugé « fallacieux » : « Près de 70 % des salariés du privé sont en réalité couverts par leur entreprise dès les premiers jours d’absence ». Cette réalité remet donc en question la volonté gouvernementale d’harmonisation. Plusieurs parlementaires s’inquiétaient également des conséquences sociales, en particulier pour les fonctionnaires aux revenus modestes qui auraient été frappés les premiers.

Vers une indemnisation plus faible des congés maladie

Si cette proposition d’allongement a finalement été écartée — une concession notable du gouvernement pour obtenir l’adoption du budget 2026 — il faut rappeler que la situation des arrêts maladie dans la fonction publique a déjà évolué. Depuis mars 2025, ils ne sont plus rémunérés qu’à hauteur de 90 % du salaire pendant trois mois, contre une prise en charge totale auparavant. Selon les autorités, cette réforme doit générer près de 900 millions d’euros d’économies annuelles. Le texte doit désormais franchir l’étape du Sénat avant un possible feu vert définitif à l’Assemblée nationale début février.

Un débat encore ouvert

Cette décision parlementaire ne clôt cependant pas la réflexion sur la gestion des arrêts maladie dans le secteur public. Les discussions autour de l’équité entre salariés privés et agents publics se poursuivent, oscillant entre impératifs économiques et préoccupations sociales. Si le gouvernement a choisi le compromis cette fois-ci, la question pourrait revenir sur la table lors des prochains exercices budgétaires, tant elle cristallise enjeux financiers et justice sociale.

Le Récap
  • Tl;dr
  • L’abandon de l’allongement du délai de carence pour les fonctionnaires
  • Des arguments contestés autour de l’alignement public-privé
  • Vers une indemnisation plus faible des congés maladie
  • Un débat encore ouvert
En savoir plus
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